U novoizgrađenoj crkvi nalazi se 13 prozora u koje su ugrađeni vitraji koji prikazuju hrvatske svece i blaženike i osvjedočene prijatelje hrvatskog naroda.

U glavnoj lađi nalazi se šest vitraja, a u samom prezbiteriju dva. Ulaskom u crkvu s lijeve strane na vitrajima su prikazani Bl. Ivan Merz i Bl. Ozana Kotorska, Bl. Drinske mučenice, a u samom prezbiteriju Sveti Nikola Tavelić. S desne strane prikazani su Sveti Ivan Pavao II. koji je bio osvjedočeni prijatelj hrvatskog naroda i koji je 2003. u Dubrovniku proglasio prvu hrvatsku blaženicu Bl. Mariju Propetoga Petković čiji se vitraj nalazi na desnoj strani. S te strane u prezbiteriju je vitraj Sv. Leopolada Mandića i Sv. Majka Terezija iz Kalkute koja je bila osvjedočena prijateljica hrvatskog naroda.

Na crkvenom koru postavljeni su vitraji na lijevoj strani Sv. Marka Križevčania, a na desnoj Bl. Augustina Kažotića.

Na pročelju crkve nalaze se vitraji Svetog Franje Asiškog i Svete Klare Asiške te okrugla rozeta Duha Svetoga. Rozeta bi simbolizira da vjernici u nju uzlaze i iz nje izlaze s Kristovim mirom.

Vitraji su rađeni i u crkvu postavljani u četiri navrata. U prvom zahvatu od 2017. do 27. srpnja 2019. urađeni su vitraji Svetog Nikole Tavelića, Blaženih Drinskih Mučenica, Svetog Leopolda Mandića i Svete Majke Terezije.

U drugom zahvatu od 27. srpnja 2019. urađena su druga tri vitraja: Bl. Marije Propete Petković, Blažene Ozane Kotorske i Svetog Ivana Pavla II.

U trećem zahvatu 2020. urađeno je pet vitraja koji predstavljaju: Blaženog Ivana Merza, Blaženog Augustina Kažotića, Svetog Marka Križevčanina, Svetog Franju Asiškog i Svetu Klaru Asišku.

U četvrtom zahvatu 2021. urađen je posljednji vitraj okrugla rozeta Duha Svetoga.

Godine 2017. tvrtka Staklorad iz Tolise i njen vlasnik gospodin Pero Oršolić po dogovoru sa župnikom fra Antom Pušeljićem izvršili su montažu vitraja (dekorativnih i uporabnih premeta od obojenog stakla) na župnu crkvu u Orašju. U kolovozu 2019. navedena tvrtka posjetila je župu Orašje i župnika fra Bonu Kovačevića kako bi njeni djelatnici nastavili izradu vitraja. Idejno rješenje vitraja i nacrti na staklu djelo su Roberta Mijalića, akademskog slikara iz Rijeke.

Vitraje su finacirali pojedinci i obitelji župe Blaženog Alojzija Stepinca kao i oni izvan župe koji su vezani za nju. Popis obitelji koje su darovale vitraje: obitelj Ante i Anice Topić iz Orašja, obitelj Mate Živkovića iz Ugljare, Mara Stanić i župljani, obitelj Kaje Damjanović, obitelj Ilije i Mirjane Ćekić iz Orašja, obitelj Josipa i Marije Babić s djecom, obitelj Ilije Oršolić-Tomić iz Orašja, zahvalni vjernici iz Orašja, Ugljare i Donje Mahale, zahvalni branitelj HVO-a iz Orašja, prvopričesnici i krizmanici generacija 2020. Vitraj rozete Duha Svetoga je dala napraviti zahvalna vjernica za uslišane molitve po zagovoru Blaženog Alojzija Stepinca Manda Tadić iz Marković Polja župa Krepšić i obitelj Zlatka i Snježane Živković s kćeri Helenom iz Dusine (Orašje).

"Zahvaljujemo se umjetniku koji je svakim vitrajem unijo novo svjetlo, toplinu i duhovnost crkvi Blaženog Alojzija Stepinca u Orašju. Nadamo se i vjerujemo da će ovi vitraji hrvatskih svetaca i blaženika i osvjedočenih prijatelja hrvatskog naroda i njihova sakralna toplina trajati i duhovno nas podsjećati na vjernost hrvatskog naroda Crkvi, a ujedno nas vjernike pozivati da istu poruku duhovne topline naši svetaca i blaženika prenosimo u svoje obitelji. Nadamo se da će ova crkva Blaženog Alojzija u Orašju ispunjena hrvatskim svecima i blaženicima biti mjesto duhovnog okupljanja i zajedničke molitve, ali i svih drugih susreta, posebno mlađih župljana koji svakodnevno u ovom prostoru pronalaze svoj mir i radost. Zahvaljujemo se Bogu, donatorima vitraja i svim ljudima dobre volje koji su na bilo koji način bili podrška u izradi vitraja, ali i u daljnjoj obnovi naše crkve.  Na kraju izražavam radost i zadovoljstvo zbog postavljanja vitraja u našoj crkvi. Sve vas pozdravljam i zahvaljujem se svima vama koji ste dali ljudsku i molitvenu potporu, a posebno obiteljima koje su darovale vitraje i svim pojedinim donatorima koji su pomogli da ovi vitraji hrvatskih svetaca i blaženika i osvjedočenih prijatelja hrvatskog naroda ugledaj svjetlo dana", napisao je župnik fra Bono.

T.M.I.,KT